Ở khu vực phía Nam, Công ty Cổ phần Vận tải Đường sắt Sài Gòn tổ chức chạy các đôi tàu Khu đoạn: Đôi tàu SE21/SE22 giữa Sài Gòn - Đà Nẵng, đôi tàu SNT1/SNT2 giữa Sài Gòn - Nha Trang (từ thứ 4 đến chủ nhật) và đôi tàu SPT1/SPT2 giữa Sài Gòn - Phan Thiết (từ thứ 6 đến chủ nhật).

Ngoài ra, từ ngày 6/9, ngành đường sắt sẽ thay đổi giờ tàu đi đến các ga trên tuyến đường sắt Bắc – Nam. Cụ thể, tuyến Thống Nhất chiều từ Sài Gòn đi Hà Nội: Tàu SE2 xuất phát Sài Gòn lúc 20 giờ 50 phút đến Hà Nội lúc 8 giờ 30 phút, tàu SE4 xuất phát Sài Gòn lúc 19 giờ đến Hà Nội lúc 5 giờ 55 phút, tàu SE6 xuất phát Sài Gòn lúc 15 giờ 25 phút đến Hà Nội lúc 4 giờ 40 phút, tàu SE8 xuất phát Sài Gòn lúc 6 giờ đến Hà Nội lúc 19 giờ 12 phút. Chiều từ Hà Nội về Sài Gòn: Tàu SE1 xuất phát Hà Nội lúc 21 giờ 10 phút đến Sài Gòn lúc 8 giờ 25 phút, tàu SE3 xuất phát Hà Nội lúc 19 giờ 20 phút đến Sài Gòn lúc 6 giờ 30 phút, tàu SE5 xuất phát Hà Nội lúc 15 giờ 30 phút đến Sài Gòn lúc 5 giờ 40 phút, tàu SE7 xuất phát Hà Nội lúc 6 giờ 10 phút đến Sài Gòn lúc 18 giờ 36 phút.

Tuyến Khu đoạn: Tàu SE22 xuất phát Sài Gòn lúc 10 giờ 35 phút đến Đà Nẵng lúc 6 giờ; tàu SE21 xuất phát Đà Nẵng lúc 8 giờ 10 phút đến Sài Gòn lúc 5 giờ; tàu SNT2 xuất phát Sài Gòn lúc 20 giờ đến Nha Trang lúc 5 giờ 40 phút; tàu SNT1 xuất phát Nha Trang lúc 19 giờ 50 phút đến Sài Gòn lúc 4 giờ 30 phút; tàu SPT2 xuất phát Sài Gòn lúc 6 giờ 45 phút đến Phan Thiết lúc 10 giờ 40 phút; tàu SPT1 xuất phát Phan Thiết lúc 13 giờ 10 phút đến Sài Gòn lúc 17 giờ 35 phút.

Cùng với việc tổ chức chạy tàu, từ nay đến ngày 27/12/2023, Công ty Cổ phần Vận tải Đường sắt Sài Gòn còn áp dụng nhiều chương trình khuyến mãi giảm đến 30% giá vé đối với tàu khách Thống Nhất SE3/4, SE7/8 (Sài Gòn - Hà Nội) khi mua vé có cự ly vận chuyển trên 900km, tàu SE21/22 (Sài Gòn - Đà Nẵng) cự ly vận chuyển trên 600km, tàu SNT1/2 (Sài Gòn - Nha Trang) có cự ly vận chuyển trên 300km, hành khách mua vé trước ngày đi tàu từ 5 ngày trở lên được giảm từ 5% đến 30% giá vé (trừ loại chỗ giường nằm khoang 4 tàu SE3, SNT1/2). Khi đổi, trả vé mức khấu trừ từ 10% - 30% giá vé. Riêng tàu SPT1/2 hành khách mua vé chặng Sài Gòn - Phan Thiết và mua trước ngày đi tàu từ 10 ngày trở lên được giảm 10% giá vé (trừ loại chỗ giường nằm khoang 4).

Hành khách mua vé tập thể có số lượng khách từ 5 người trở lên được giảm giá từ 2% đến 14% giá vé. Còn hành khách mua vé khứ hồi được giảm 10% giá vé lượt về. Khuyến khích các tập thể mua vé số lượng lớn, mua nguyên đoàn tàu… Công ty sẽ lập tàu riêng với thời gian đi, đến theo yêu cầu và giá cả thỏa thuận.

Công ty vẫn áp dụng giảm giá cho các đối tượng chính sách xã hội như: Mẹ Việt Nam anh hùng, thương binh, người nhiễm chất độc hóa học, người khuyết tật, người cao tuổi, sinh viên, trẻ em, đoàn viên công đoàn, hành khách có thẻ khách hàng.